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国外追踪
用RNA揭示生理性病害风险
添加时间:2019-09-02 10:13:31      浏览次数:173      作者:【美】Kate Prengama  【 】  关闭窗口

 

在收获时测试‘蜜脆’中的生物标记可以估计储藏期病害的可能性并为营销决策提供信息。 

16-10 苹果采后生理性病害测试试剂盒

AgroFresh提供的新的生物标志物测试可以帮助仓库管理者更好地决定蜜脆的储存方式,同时了解有多少水果容易被软烫伤和留下苦痘。预测性筛选试剂盒包括所有需要的设备,将果皮榨成汁,然后滴下足够的果汁,填满取样卡上的圆圈,然后送回公司位于华盛顿的Yakima实验室进行分析。

大多数采后病害在空气稀薄的情况下不出现。

情况是这样,当苹果进入贮藏以前品相完好,但储藏几个月后就会出现苦痘或类似烫伤的症状,其实这些储藏期病害的出现是在生长季就留下了隐患。如果你知道怎么去找的话,有储藏期病害发生风险的苹果在收获时甚至在收获前,就已经显示出警告信号。

在水果的生理学中这些看不见的标志被称为生物标志物,生物标志物的可视化为制定更好的储存和营销决策提供了有价值的工具。

这是AgroFresh新的预测筛选技术目标,该技术允许种植者在收获时从‘蜜脆’果皮中取出小样品,将这些样品一夜之间邮寄到公司位于华盛顿州Yakima的实验室,并在几天内得到结果,估算软烫伤和苦痘病的风险。

“种植者如何使用这些信息?我们知道气调库可以使‘蜜脆’减少软烫伤,但气调库会增加苦痘病,因此,这些信息可以帮助您决定如何达到平衡,基因组学首席研究员Nigel Gapper说道,他在12月华盛顿州树木果树协会年会上介绍了该技术。

这种洞察力并不便宜,每个测试套件需几百美元,但如果它可以防止大量的‘蜜脆’因晚期发现的生理性病害而造成的损失,那么它可能是值得的。

“如果你有能力提出有关水果如何表现的问题,你一定会想知道,”华盛顿州Wenatchee的美国农业部生理学家大卫·鲁德尔说,他研究了采后病害的生物标志物。

新的商业测试基于他和其他人十年前开始的研究,研究苹果在基因表达和代谢物方面的差异,最终弄清楚哪些差异是病害发展的强有力指标。

最早的发现之一是表面烫伤的生物标志物,Rudell开发了一种方法,仓库管理员可以用它来测试有机‘澳洲青苹’。但是,所需实验室工作的复杂性可能使许多人无法实现。AgroFresh的风险评估测试是第一个使生物标记测试更容易获得商业化产品。

Gapper在接受Good Fruit Grower后续采访时说,本季,该公司计划帮助感兴趣的种植者介绍这项技术,派遣训练有素的员工演示如何使用取样工具。

将一个生产区块中四个不同区域的果皮样品浸渍,然后提取果汁并滴到含有特殊化合物的纸卡上以稳定RNA,以便在实验室进行分析。

Gapper使用RNA生物标记,指示哪些基因正在积极地转化为蛋白质。“这是第一个可测量的基因表达变化,”他说。“代谢物是最后一种。”现在已经有超过60,000RNA分子在苹果中测序。

Gapper说,目前,这项测试是基于“一系列的指标”,但他希望最终能扫描样本中的数百个分子,因为它们能找到更多的标记并提高准确性。

他说,对于软烫伤,目前的测试准确率为80%,误报率为16%,这将导致过度保守的决定。

“我们有大约4%的假阴性,这对我们来说是个问题,但是我们有96%的信心”,Gapper说。

苦痘病的准确度更好:85%的总体准确度,12%为假阳性,3%为假阴性。

结果将在几天内通过AgroFresh的数据管理平台FreshCloud发回。Gapper说,他没有给出建议,只是分析以帮助做出决策。

Gapper说,‘富士’的软腐、‘嘎啦’内部损伤、皮孔分解和二氧化碳伤害的测试都正在进行中。

Rudell说,从研究的角度来看,他们可以为任何感兴趣的生理病害找到生物标志物。问题是哪些标记足以使测试有价值,这取决于仓库有什么选择。如果测试在收获前进行,种植者就能知道他的水果有发生哪种生理性病害的风险,这对于种植者也是有用的。

例如,对于‘澳洲青苹’的表面软烫伤,包装工可能会选择处理有机生长的水果,这种水果表现出对传统化学物质的敏感性,从而将病害降到最低,鲁德尔说。

或者他们可能会决定不使用‘蜜脆’,以减少产生苦痘病的几率。

“这是探究苹果如何在冷藏链中发挥作用的开始,”他说。“它与淀粉规模或矿物分析没有什么不同。这些只是更复杂的工具。

(孙杨 译,王树桐 校)

来源:https://www.goodfruit.com/revealing-risks-with-rna/

 
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